①蚯蚓粪应尽可能使用新鲜的，而且是经过短期发酵的，发酵可使其中不够腐熟的粪料彻底熟化，使有益微生物增殖更多，肥效也会更高。蚯蚓粪不宜保存过久，否则肥效会明显下降。
②蚯蚓粪虽营养全面，但养分含量稍显不足，所以与无机肥配合使用效果更佳，但不宜与速溶性化肥掺混使用。此外，蚯蚓粪的土壤改良效果是比较慢的，如果土壤问题严重，还是建议施用海精灵生物刺激剂(淋根型)加以改善。
③蚯蚓粪不宜暴晒和高温烘干，高温使微生物活性降低。
④因蚯蚓粪中含有大量有益微生物，所以蚯蚓粪不宜与杀菌剂配合使用。
⑤蚯蚓粪所配置的悬浊液对病害防效不太稳定，病害多发时，该用药用药，切勿耽误防治工作。
